Fakültemiz 24 Kasım 1962 yılında Yüksek İslam Enstitüsü adıyla Milli Eğitim Bakanlığı'na bağlı 4 yıllık öğretmen yetiştiren bir kurum olarak öğretime açılmış ve ilk mezunlarını 1966 yılında vermiştir. 20 Temmuz 1982 tarihinde Selçuk Üniversitesi'ne bağlanarak İlahiyat Fakülteleri arasına katılmıştır. Fakültemiz hâlen Konya il merkezinde Meram Yeni Yol üzerindeki binasında öğretime devam etmektedir.
Bilgisayar laboratuvarı, yabancı dil laboratuvarı, yemekhane, sportif tesisler, öğrenci kulüpleri ve kantin hizmetleri ile öğrencilerimizin her türlü sosyal faaliyetlerine imkan tanınmaktadır. Açık raf sistemine geçmiş olan kütüphanemiz, öğrencilerimize araştırma ve geliştirme imkanı tanımaktadır. Ayrıca fakültemiz yerleşmiş bir bilgi işlem ortamı sayesinde öğrencilerimize gerek kayıt gerekse not öğrenimleri konusunda çağın gerektirdiği internet ayrıcalığını sunmaktadır.
Fakültemiz mezunları, Milli Eğitim Bakanlığı bünyesinde Din Kültürü ve Ahlak Bilgisi ve İmam Hatip Liseleri meslek dersleri öğretmeni olarak çalışabilmekte, ayrıca Diyanet İşleri Başkanlığı'na bağlı çeşitli birimlerde görev alabilmektedirler. İmam Hatip Liselerine öğretmen olacak olan İlahiyat Lisans Programı mezunları, alacakları pedagojik formasyon ve mesleki bir ek eğitim ile daha ehliyetli ve nitelikli öğretmenler olarak yetişmiş olacaktır.
7/12/2011 tarihli ve 2011/2620 Sayılı Bakanlar Kurulu Kararının 27 Aralık 2011 tarihinde Cumhurbaşkanımız Abdullah Gül tarafından onanması ve aynı gün 28155 Sayılı Resmi Gazete'de yayınlanması üzerine, Fakültemiz Konya Üniversitesi'ne bağlanmıştır.
Fakültemiz 3 ay 15 gün Konya Üniversitesi adı altında eğitime devam ettikten sonra 11 Nisan 2012 Çarşamba 28261 sayı ile Resmi Gazete'de yayınlanan 6287 nolu Kanunun 20 maddesinin yürürlüğe girmesiyle Necmettin Erbakan Üniversitesi İlahiyat Fakültesi olarak 1 Kasım 2016 tarihine kadar eğitim faaliyetlerini sürdürmüştür.
Son olarak Resmi Gazete'de yayımlanan 26/09/2016 tarihli ve 2016/9270 sayılı kararnamenin ekinde yer alan Madde-2 uyarınca Fakültemizin ismi 1 Kasım 2016 tarihinde Ahmet Keleşoğlu İlahiyat Fakültesi olarak değiştirilmiştir.